人類乳突病毒（HPV）與子宮頸癌和頭頸部癌有關，最近研究也發現人類乳突病毒與陰莖癌有關，高惡性度鱗狀上皮病變陰莖癌被檢測出有87%呈現HPV陽性，侵襲性陰莖癌也有33%呈現HPV陽性。

人類乳突病毒跟女性子宮頸癌及兩性頭頸部癌有關，最近又有研究指出人類乳突病毒與陰莖癌有關，而且都發生在侵襲性及高度鱗狀上皮病變的惡性度陰莖癌。陰莖癌可以分成兩種，一種是發炎或皮膚病變所引起，另外一種則是人類乳突病毒感染有關，以前的研究指出人類乳突病毒感染約佔50%以上。最近西班牙巴塞隆納Alemany博士跟他的團隊研究陰莖癌是否與人類乳突病毒感染有關，因此他們檢測了85名高惡性度鱗狀上皮病變及1010名侵襲性陰莖癌的病患病理組織，這些病患分別來自25個國家，結果發現高惡性度鱗狀上皮病變有87%檢測出HPV陽性，侵襲性只佔了33%。高惡性度鱗狀上皮病變分佈在很多國家，大洋洲佔55.6%，非洲36.8%，拉丁美洲36.5%，歐洲32.2%，亞洲佔了13.4%，北美18.8%，所以高惡性度鱗狀上皮病變引發陰莖癌確實與地區有關。HPV感染與HPV 16型及18型有關，所以很多貧窮的國家都鼓勵女性注射HPV疫苗，現在也推廣到男性上，但是這種疫苗注射還是有其副作用，很多國家從強制性注射變成推薦性，但是很多專家如美國Ann Arbor主張雖然陰莖癌發生率很低，但是還是鼓勵接種疫苗，因為不止女性可以預防子宮頸癌，男性也同樣預防頭頸部癌。