胃癌與大腸癌的早期診斷方法除了糞便檢查外，最好的方式還是做大腸鏡或是胃鏡檢查。糞便檢查是非常沒有特異性的，大腸鏡或胃鏡是一種侵入性的檢查，很多病患因為害怕疼痛而不願接受此種檢查，事實上目前有很好的麻醉，檢查中根本不會感到任何不適，不過科學家這幾年來一直努力研究各種非侵入性的準確診斷方式，尤其是用生物學的方式，例如從糞便中找到有罹患胃癌跟大腸癌危險性的特殊基因。最近日本的Okayama大學的Nagasaka醫生所提出來的研究報告從糞便裏的DNA的RAFF2及SFRP2兩個基因。如果被甲基化的話就有可能是罹患腸胃道癌症的徵兆。從有或沒有罹患胃腸道腫瘤的296名正常人或病患中做檢查，結果發現了有大腸直腸癌的75%病患糞便的DNA甲基化，胃癌的有57.1%，進行性的大腸直腸腺腫是44.4%；健康的人只有10.6%。所以如果作RAFF2及SFRP2基因甲基化糞便DNA檢查為陽性的病患，都應該接受大腸鏡及胃鏡檢查等更進一步檢查。不過還是有25%～43%可能有問題但是無法檢驗出來。當然以上的研究只是一個初步報告，還是需要更大規模的精密臨床試驗才能確定。