最近研究發現利用分子生物學PAM50基因的表現來分類轉移性乳癌病患是屬於那一種內在亞型後，再利用標靶治療、荷爾蒙治療來治療病患療效更佳。

轉移性乳癌可以分類成幾種內在亞型，傳統是利用免疫染色的方式，並不是很準確，HER2陽性可以利用傳統的方式檢測，但是現在都利用PAM50基因表現來分類轉移性乳癌的內在亞型，可以更為精確詳細，可以分成腺腔A型（luminal A）、腺腔B型（luminal B）、HER2富集（HER2-enriched）、基底樣（basal-like）等四種。發現利用荷爾蒙治療加上或不加上抗小分子HER2抗體lapatinib可以利用PAM50基因表現來分類並清楚的分析預後，如果是HER2陰性、luminal A病患，無疾病惡化期是16.9個月，luminal B是11.0個月，HER2富集是4.7個月，基底樣是4.1個月，而全存活期分別是45、37、16和23個月。這些病患需不需要使用lapatinib，傳統方法檢查是HER2陰性病患，使用PAM50基因檢測為HER2陽性病患使用lapatinib會有療效，臨床上疾病無惡化存活期是6.49個月，不使用這種治療的話只有2.6個月。所以利用標靶治療、荷爾蒙治療來治療病患必須先用分子生物學來分類病患的內在亞型，因為HER2陰性的病患利用傳統的檢測方式可能檢測不出病患分類，基底樣亞型的病患如果能利用標靶治療能延長病患生命，所以利用PAM50基因檢測可以決定哪一種亞型必須使用荷爾蒙治療加上抗HER2標靶治療。