東方的小孩切除扁桃腺者較少，但是在西方小孩一旦扁桃腺肥大影響呼吸就會切除扁桃腺，由於扁桃腺屬於淋巴系統，所以切除扁桃腺到底對於免疫系統有沒有影響目前還沒有結論，但是最近有研究發現扁桃腺癌發生率比較高的國家，如果切除扁桃腺可以減少扁桃腺癌，但是並不鼓勵一般民眾切除扁桃腺，作為預防扁桃腺癌的措施。 這是美國Johns Hopkins的Fakhry醫師所作的研究，從1977年到2012年丹麥癌症登記的380萬個成年人資料，研究扁桃腺切除是否跟口咽癌有關，從1977年開始小孩接受扁桃腺切除的人數就開始下降，每年下降1.1%，經過35年的追蹤減少了33.8%，有趣的是口咽癌的發生率卻是相反的增加了，口咽其他的癌症並沒有增加，只有增加扁桃腺癌，他統計發現切除扁桃腺可以減少60%發生扁桃腺癌的機會，如果是扁桃腺癌病患在診斷一年內除扁桃腺，有47%可以延長無疾病存活期。 口咽癌跟人類乳突狀病毒（HPV）有關，現在也發現到77%扁桃腺癌病患也有HPV的感染，小孩因為扁桃腺肥大切除扁桃腺，就能夠減少感染HPV的風險。但是Fakhry醫師並不鼓勵小孩將切除扁桃腺作為預防措施，不過對於因為扁桃腺肥大而切除的小孩算是個好處，因為可以減少扁桃腺癌的發生。