腸道基質瘤（GIST）是一個比較少見的肉瘤，主要是從Cajal細胞惡化而長出來的腫塊，以前早期發現除了外科手術，沒有更好的治療方法。但是即使外科手術，它的復發率還是很高。後來美國基礎分子生物研究者發現胃腸道基質瘤細胞表面的Kit基因會異常，而Gleevec本身對Kit異常的癌症有療效，所以美國食品藥物管理局批准Gleevec用在轉移性或復發性的胃腸道基質瘤病人。由於外科手術後的胃腸道基質瘤病人，因為即使治癒性的外科手術後，它的復發率還是很高。因此最近胃腸道基質瘤外科手術後給予Gleevec與否的研究也發現給予Gleevec的病患一年後的復發率低於對照組，所以Gleevec可以當作輔助治療來減少外科手術後胃腸道基質瘤的復發。