淋巴瘤本身很好治療，但是中樞系統的淋巴瘤因為藥物不容易通過腦的血管屏蔽，所以治癒率很低，一般都是用放射線治療，但是這種病人的年紀通常很大，所以即使是用放射線治療，存活期也大概只有一年左右。[@more@]

最近美國波士頓Massachusetts綜合醫院癌症中心的Batchelor醫師用簡單的方法就能讓病患存活很久，他研究25個中樞神經系統淋巴瘤的患者，追蹤了至少6.5年後，發現其中的12位病患（52%）達到完全緩解。追蹤6.8年後，還有5位（40%）沒有復發。

Methotrexate雖然屬於高劑量，但是副作用很少，這些治療失敗的病人，其中11個病人是疾病惡化，包括不明原因，另外3個病人死於其他不明原因。Methotrexate雖然劑量很高，病人可能會出現紅血球、白血球、血小板減少或者口腔潰爛等等，這些副作用一般病人都能忍受，雖然目前還有其他方法來治療病人，但是目前只有高劑量的Methotrexate能達到很好的療效，將來這種藥單獨使用，或者是混合其他藥物例如temozolomide、標靶治療、topotecan一起合併使用應該更會增加療效。